夏休みのある日。大探検旅行にあこがれ、航空写真の中から魔境を探すのび太たち。そんな中のび太は、空き地で一匹の子犬・ペコに出会い、飼うことになる。そのペコがなんと、山積みの航空写真の中から、ジャングルの奥地に立つ謎の石像を見つけ出した。不思議に思ったのび太たち5人とペコは、“探検隊”として巨神像の謎を解き明かす旅に出発する。