9・11以降の“テロとの戦い”は転機を迎えていた。先進諸国は徹底的な管理体制に移行してテロを一掃したが、後進諸国では内戦や大規模虐殺が急激に増加していた。米軍陸軍大尉クラヴィス・シェパードは、その混乱の背後に常に存在が囁かれる謎の男、ジョン・ポールを追ってチェコへと向かうが……。