東西冷戦中の1960年代。アメリカとソ連は、互いに超敏腕エージェントを抱えていた。そんな折、ナチスの残党が国際犯罪組織と手を組み、核兵器によって世界の勢力バランスを揺るがそうとするテロ計画を進めていた。CIAのナポレオン・ソロと、KGBの若き超エリートであるイリヤ・クリヤキンは、互いの任務のために敵でありながらタッグを組むことに。任務遂行の手がかりは、犯罪組織に潜入するための鍵となる、失踪したドイツ人科学者の娘だけで……。