二ツ坂高校に入学した東島旭は、宮路真春という上級生と出会い、彼女の入っているなぎなた部に入部する。身長も低く運動オンチな旭だが、同じ一年生の八十村将子、紺野さくらとともに過酷な練習に耐え抜いていく。しかし二ツ坂高校は夏のインターハイ予選で、ダークホースの國陵高校に敗れてしまう。2年生と1年生の新体制になったなぎなた部は、山奥の尼寺で地獄の夏合宿を行い、なぎなた教士の寿慶から猛特訓を受けることに…。