幕末の京都。花街で＜島原輪違屋＞に身を置く、天神糸里（藤野涼子）。ある日、姉と慕う音羽太夫（新妻聖子）は、新選組筆頭局長芹澤鴨に無礼打ちされる。壬生浪の非道に島原は騒然となるなか、その場を収めたのは新選組副長・土方歳三（溝端淳平）だった。そして糸里が淡い恋心を抱くのが、土方歳三だった。糸里とは仲の良い桔梗屋の芸妓吉栄（松井玲奈）は芹澤の腹心の平山五郎（佐藤隆太）と恋仲で、お梅（田畑智子）は芹澤鴨（塚本高史）の愛人だった。初期の新選組には、近藤勇と芹澤鴨という二人の局長が存在していた。両派は対立を深めていくが、それは「百姓」と「武士」という決して超えられない壁でもあった。やがて持ち上がる芹澤鴨暗殺計画。男たちの抗争の陰で翻弄されていく糸里、吉栄、そしてお梅。彼女たちは一体何を見て、何に殉じるのか。そして最後に下した決断とは…。