想像力豊かで内気な少女・ボニーの成長を、そばで見守ってきたカウガール人形のジェシー。
しかし、タブレット〈リリーパッド〉の登場で日常は大きく変わる。
「みんなの時間がタブレットに支配されている」―他の子どもと同じように画面に夢中になり、このままでは遊びの中で輝いていたボニーの笑顔が失われていく…その一大事にジェシーは、ウッディに助けを求める。
再びタッグを組んだウッディとバズと共に、ジェシーはボニーの心を取り戻せるのか？
時が流れても、おもちゃにできること――冒険の果てにたどり着く究極の答えとは？

※2D吹替版です。