西暦2036年。緊張すると声が出なくなってしまう場面緘黙症を患う伊勢田みゆきは、人工ブラックホールの研究を行う「人工縮退研究所」の総務部職員として勤めていた。
ある日、同研究所の赤城容子教授が見えない時間の壁「ボブル空間」を作り出し、３時間後に時間犯罪を起こして人類に復讐することを予告する。
研究所のほとんどが機能しなくなった中で偶然にも難を逃れた伊勢田は、事件解決のカギを握る同研究所准教授の吉住あおいをボブル空間から救出することを決意。
次々と発生するボブル空間により崩壊していく世界。果たして人類滅亡を阻止することができるのか。