ニューヨークに暮らす青年ノアは、ある日謎めいた車に閉じ込められる。
車は警察とカーチェイスを繰り広げたあげく、ロボット生命体“トランスフォーマー”へと変形、ノアは戦いへと巻き込まれてしまう。
あらゆる星を丸呑みにして食べ尽くす、神話だと思われた宇宙最悪の災い“ユニクロン”が、地球を次の標的に動き出していた。ユニクロンの残忍な先遣隊スカージの攻撃に遭い、絶体絶命のオプティマスプライムとオートボットの前に、動物に変形するビーストたちが現れるのだった。
果たして、オートボットとビースト、そして人類は、ユニクロンによる地球消滅の運命を変える事が出来るのかー!?

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