最終決戦の先に待つ感動のラスト！求め続けた身体と引き換えに、兄弟が出した答えとは――？

国家中枢には、国民の魂と引き換えに完全な存在になろうと企てる最大の敵――ホムンクルスたちの生みの親”お父様”が潜んでいた――。エドとアルの兄弟と、軍の暗部に立ち向かうマスタングたち、そして賢者の石を求めるシンからの来訪者は、共闘し、この陰謀を阻止できるのか？そして全ての鍵を握るエドとアルの父親の正体とは？彼が語る“約束の日”とは一体何なのか？残された時間はあとわずか――求め続けた身体と引き換えに兄弟が出した最後の答えとは？