北極から現れた、謎の火喰亀。その名はガメラ！人類は、この未知の脅威にどう立ち向かうのか―。
亀の研究調査のために北極を訪れた日高教授と助手の山本、帯同する新聞社のカメラマン青柳は、氷山から出現した大怪獣、”ガメラ”を発見する。ガメラは空を飛び、遠く北海道の灯台を襲撃。亀をこよなく愛する少年・俊夫はガメラに助けられ、その後ガメラの跡を追うようになる。日本各地を襲うガメラに対抗すべくあらゆる作戦が実行されるが、ことごとく失敗。人類の英知は、ガメラに屈するのか―。大人気特撮シリーズの記念すべき第一作目。